在商标代理行业，代理机构自行注册商标是一个备受关注的话题。根据《商标法》规定，商标代理机构除了代理服务申请商标注册外，不得申请注册其他商标。这一规定限制了代理机构自身注册商标的权利，为了规避法律风险，代理机构需要寻找合法途径来处理这一问题。

业内通行的处理方式是通过注册一家新的关联公司负责商标品牌管理或知识产权代理事宜。例如，一些知名企业如阿里巴巴、腾讯等，在国内注册了专门负责商标代理业务的公司，以此来规避商标代理机构自注册商标的限制。这种方式在一定程度上解决了问题，但在部分司法实践中，与商标代理机构有关联的公司、法人代表、董事、监事、高管、股东、合伙人甚至是亲戚家属，都有可能被认定为“商标代理机构”，从而受到法律规制。

为了应对这一情况，一些代理机构采取了代持协议的方式来注册商标。代持协议是一种合法的方式，通过委托他人持有商标所有权，实现商标的注册和管理。商标注册的主体是与代理机构无直接关联的公司，然后再通过授权的方式允许关联公司使用。这种方式在一定程度上降低了法律风险，同时也便于企业运营和管理。

近期，国家知识产权局印发了关于《2021年地方知识产权业务受理窗口工作要点》的通知，其中明确指出严禁聘用专利、商标代理机构人员为窗口工作人员。这一政策表明了政府对商标代理行业的监管力度，同时也提醒代理机构在经营过程中要遵守法律法规，规避风险。

总的来说，商标代理机构自注册商标的问题是一个复杂的法律和实践问题，需要代理机构在遵守法律的前提下寻找合法的解决途径。通过建立关联公司、签订代理合同等方式，可以规避法律风险，确保商标代理机构的合法经营。同时，代理机构也应加强自身的专业素养，提升行业自律意识，成为德才兼备的优秀从业人员。

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